以基因組為中心解析北美白堊紀(jì)晚期尖角龍化石中的新型微生物譜系
時間:2025-12-08 00:15:32 來源:桑間濮上網(wǎng)
北美白堊紀(jì)晚期出土的尖角龍骨骼化石中由微生物介導(dǎo)的潛在生物地球化學(xué)途徑的示意圖(神秘的地球uux.cn報道)據(jù)中國科學(xué)院深海科學(xué)與工程研究所:近日,地外海洋系統(tǒng)研究室劉翠艷研究員作為共同作者在國際學(xué)術(shù)期刊《Environmental Microbiome》發(fā)表了題為“Genome-centric resolution of novel microbial lineages in an excavated Centrosaurus dinosaur fossil bone from the Late Cretaceous of North America”的組為中心中學(xué)術(shù)論文。
古生物學(xué)研究曾頻繁報道:中生代恐龍化石經(jīng)過約2.5億年~6500萬年仍然出乎意料地保存著內(nèi)源性有機物(如膠原蛋白和血管)。北美白堊但考慮到蛋白質(zhì)易于降解,期尖并且在逾百萬年的化石時光里微生物很多已聚居于骨骼中的孔隙內(nèi),這些內(nèi)源性的新型系軟組織是否可以殘存在中生代化石骨骼中是一直備受爭議的。盡管研究人員對蛋白質(zhì)的微生物譜不穩(wěn)定性進行了廣泛研究,恐龍化石骨骼中微生物群的基因解析紀(jì)晚角龍基因組多樣性及其在化石形成學(xué)(又稱埋藏學(xué))中的潛在作用仍不明晰。因此,組為中心中研究人員對從白堊紀(jì)晚期尖角龍骨骼及其表面的北美白堊泥巖中發(fā)現(xiàn)的微生物進行了基因組分析,從而深入了解微生物改造骨骼化石的期尖潛力。
本研究從宏基因數(shù)據(jù)組裝出46個高質(zhì)量的化石基因組,分別代表6個細(xì)菌門及1個古菌門。新型系基因組的微生物譜分析和比較結(jié)果指出這些基因組大部分都顯示是新的綱、目、基因解析紀(jì)晚角龍科、屬或種且未曾成功被分離為純培養(yǎng)。相比包裹骨骼的泥巖樣品,骨骼富集了Nitriliruptoria, Deltaproteobacteria and Betaproteobacteria幾個綱里的基因組。對基因組功能基因的詮釋,揭示了多個物種可能參與碳、氮、硫和鐵的代謝。蛋白組學(xué)分析發(fā)現(xiàn)很多微生物基因已表達,相反,沒有發(fā)現(xiàn)內(nèi)源性恐龍膠原蛋白肽。研究表明:出土的恐龍骨骼是微生物(包括新譜系)的棲息地;與外部沉積物相比,骨骼化石內(nèi)部獨特的微生境和地球化學(xué)組分支持了較高的微生物生物量,也包含多組基因相互聯(lián)系的生物地球化學(xué)過程;這些微生物群落在中生代恐龍化石中的存在敦促科學(xué)家們在尋找殘存的內(nèi)源性生物分子時,必須格外審慎。
原文鏈接:https://environmentalmicrobiome.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40793-020-00355-w
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